Tartu Ülikoolis saab õppida kaheksas doktoriõppe programmis, mis jagunevad paljudeks erialadeks. Programme koordineerivad neli doktoriõppe keskust:
Humanitaarteaduste ja kunstide valdkonna doktoriõppe keskus
Sotsiaalteaduste valdkonna doktoriõppe keskus
Meditsiiniteaduste valdkonna doktoriõppe keskus
Ajaloo- ja arheoloogia instituudi erialad
Eesti ja üldkeeleteaduse instituudi erialad
Filosoofia ja semiootika instituudi erialad
Kultuuriteaduste instituudi erialad
Maailma keelte ja kultuuride instituudi erialad
Usuteaduskonna erialad
Sotsiaalteaduste valdkonna doktoriõppe keskuse koduleht
Meditsiiniteaduste valdkonna doktoriõppe keskuse koduleht
Loodus- ja täppisteaduste valdkonna doktoriõppe keskuse koduleht